刘备惩罚过诸葛亮，那是在关羽死了以后刘备要举倾国之兵去讨伐东吴，诸葛亮等大臣苦苦相谏刘备根本不听，这次干脆就不带诸葛亮前去直接把诸葛亮留在西川保太子刘禅留守，这等于就是不信任诸葛亮了也算是惩罚诸葛亮，就连赵云也被派到江州总督粮草，因为赵云也反对刘备出兵也受到了刘备的责罚。

三国演义中诸葛亮哭刘备是因为诸葛亮和刘备的感情很深，诸葛亮既感恩刘备三顾茅庐之情，也感恩刘备对自己的信任，诸葛亮自从出山辅佐了刘备之后，刘备对诸葛亮的话言听计从，不允许手下任何人对诸葛亮不敬，诸葛亮也对刘备非常忠心，为了刘备的霸业鞠躬尽瘁，死而后已

主要是那时候刘备担心诸葛亮会夺权。

具体来说，根据陈寿在《三国志·诸葛亮传》中的记载，刘备临终托孤的时候，对诸葛亮表示：“君才十倍曹丕，必能定国，终成大事。若嗣子可辅，辅之；如其不才，君可自取”。对此，在笔者看来，不管诸葛亮有没有篡夺蜀汉江山的想法，刘备这句话都是在迫使诸葛亮表态，特别是表忠心。举例来说，假设你在一个家族企业上班，总经理快要退休的时候，跟你说你可以取代他的儿子，成为总经理。这个时候，你会怎么回答呢？肯定是谦让，并表示要辅佐总经理的儿子。

由此，对于这一刘备的这席话，看似非常诚恳，但是诸葛亮显然不会表示自己答应你，等以后刘禅不堪大用，自己就取代他。这样一说，诸葛亮在蜀汉显然无法立足了。也即其只能痛哭流涕，表态自己一生都为蜀汉尽忠的态度。当然，对于刘备、诸葛亮这对君臣之间，并非毫无信任可言，但是，自古以来，君王都会防止大臣独掌大权，在法正、庞统、关羽、张飞等文臣武将去世后，蜀汉几乎无人是诸葛亮的对手。所以，为了刘禅可以坐稳江山，刘备必须要诸葛亮表忠心。